【質問】
「分」を表す語は minute という専用の語があるのに、「秒」を表す語はなぜ「２番目」という意味の second を使うのですか？
【回答】
今回の質問は、時間を表す語（hour, minute, second）がひととおりそろったところで生徒からよく受けるものです（ただ、一方で「そんなことには気づきもしなかった」という人が多いのも事実です）。この質問への回答の鍵となる語があるので、まずはそこから話を始めましょう。その鍵となる語というのは、minute です。
この語がなぜ日本語で「分」という意味になるのかという点を見てみましょう。辞書でこの語を調べると、minute という語が２つ見出し語になっていることに気づくと思います。１つは、みなさんもよく知っている「分」を表す名詞で、minute「ミニュット」と発音します。もう１つ（たいていは２番目にリストされています）は、「微小な、微細な」を表す形容詞で、minute「マイヌート」と発音します（それぞれ太字はアクセントの位置を表します）。
そもそも minute が「分」という名詞として使われるようになったのは、minute（「微小な」）という形容詞が元になっているからで、「より小さい物」というのが元の意味です。そして、hour（「時」）を60等分した、つまり小さく分けたものを minute と呼ぶようになったわけです。日本語の「分」もこの「分けた」というところから来ています。
しかし、hour を細かく分けた minute でも、感覚的にはけっこう長い時間がありますよね。そこで、minute をさらに60等分した時間が考えられました。この「さらに」分けるというのは「２番目の」分ける行為を指します。そうしてできあがった時間の単位を「２番目の」を表す second にしたというわけです。つまり、"second" とは "second minute" のことなのです。なお、日本語の「秒」をこれに宛てているのは、この漢字が「きわめて微細」という意味を表すからです。